Linuxでの環境変数設定

環境変数などを設定するには
/etc/profile.d
の位置にファイルを作成します。

例えばjava.shというファイルに

export JAVA_HOME=/usr/java/jdk1.5.0_06

また、java.cshというファイルに

setenv JAVA_HOME /usr/java/jdk1.5.0_06

を設定しておきます。
するとシェル起動時には読み込まれています。