JDOで削除

JDOのオブジェクトを削除します。

  PersistenceManager pm = SessionManager.get().getPersistenceManager();
  try {
   Shop oldShop = pm.getObjectById(Shop.class, Long.valueOf(id));
   pm.deletePersistent(oldShop);
  } finally {
   pm.close();
  }

更新時と同じくgetObjectById()でオブジェクトを取得して
deletePersistent()で削除を行います。

簡単ですね。